結局、たまに動かないのはパブリックサーチの取得でエラー出してるからでした。
パブリックサーチを取得する頻度が高すぎると、APIから怒られるみたいです。
という訳で、リプライのRTのみ1分おきにして、
パブリックサーチのRTを5分おきにしてみました。
これでもたまに怒られるけどそれは仕方ない。